Support de cours de microbiologie DUT HSE - IUT - Université Bordeaux 1 

Introduction

La microbiologie est la science qui étudie les organismes vivants microscopiques appelés communément microbes, soit :

En Hygiène et Sécurité et à de très rares exceptions près les deux champs de la microbiologie qui nous intéressent, sont : l'étude des Bactéries (Bactériologie) et dans une moindre mesure, celle des Virus (Virologie). Nous complèterons ces deux parties par quelques éléments d'Immunologie qui traite des défenses de l'organisme.

Le but de cet opuscule est d'assimiler un certain nombre de notions qui seront utiles dans le cadre des enseignements thématiques de deuxième année mais aussi de sensibiliser à la technique microbiologique qui, comme vous allez le voir, est très particulière.

Le risque microbien peut être défini par 2 grandeurs :

* La gravité de la maladie que le microbe peut provoquer chez l'homme

* La probabilité d'occurrence, probabilité d'attraper la maladie (ou sa fréquence dans une population).

Nous pouvons définir 2 champs d'application de ce risque particulier :

* l'ouvrier en milieu industriel

* les populations via l'écosystème

Le Risque microbiologique 

1) Les maladies microbiennes et la protection des travailleurs 

 

* Régime général des maladies professionnelles

* Maladies à caractère professionnel

De nombreuses autres maladies microbiennes ne sont pas reconnues comme maladies professionnelles néanmoins leur existence est liée à l'exercice d'un métier ; ce sont les maladies à caractère professionnel.

- Maladie des gaveurs de pigeon (aspergilloses pulmonaires Champignons ; C)

- Maladies des tunnels de séchage des pâtes alimentaires

piscines, agro alimentaire - candidoses (C) et autres aspergilloses, maladies bactériennes (B)

- Intoxications professionnelles mycotoxicoses diverses, ergotisme (ergot du seigle ; C)

Conclusion générale :

* Le risque microbiologique pose des problèmes d'hygiène publique et d'hygiène industrielle

* Réglementation internationale (O.M.S. certificat international de vaccination)

* Apparition en Europe de " nouvelles maladies " transportées par les moyens de transports modernes (avion en particulier).

 

2) Les maladies et la protection des populations

* Microbes utiles à l'homme,

- Génie biochimique (fabrication de substances chimiques)

- Ecologie et recyclage de la matière (voir cours H.S.P.)

* Microbes pathogènes : agent des maladies infectieuses et toxicoses ; sont très variés.

* Toxicoses alimentaires :

- infection à Salmonelles (Salmonelloses)

- infection à Brucelles (Brucelloses)

- infection à Staphylocoques (Staphylococcoses)

- le Botulisme

* Maladies infectieuses

- elles sont très nombreuses

- certaines maladies doivent faire l'objet d'une déclaration obligatoire ou facultative aux autorités sanitaires compétentes (voir tableau suivant)

- l'épidémiologie est la science qui étudie le mode de transmission des maladies

- la désinfection en cours de maladie (C) ou terminale (T) sont parfois obligatoire, l'épouillage (E), la dératisation (DR), la désinsectisation (DI), la démoustication (DM) sont parfois utiles pour éliminer ou faire diminuer l'importance de certaines épidémies.

- la désinfection est une opération complexe, de façon schématique on utilise :

+ les agents physiques : incinération, chaleur sèche, chaleur humide, rayon U.V. etc

+ les agents chimiques oxydants (Chlore, Brome, KMnO4, eau oxygénée, ozone) alcalis (KOH, chaux)

+ antiseptiques (formol, étuves à formol) etc...

 

a) Maladies à déclaration facultative

Grippe (V), pneumonie ou bronchopneumonie (B), oreillons (V), rubéole (V), varicelle (V), méningites virales (V), hépatites virales (V), infections digestives à salmonelles (typhoïde et paratyphoïde) B, infection cutanéo-muqueuses à staphylocoques (B)

 

 b) Maladie à déclaration obligatoire

Plan du cours de Bactériologie (Chapitre 1)

I - Etude de la cellule bactérienne 

A - Ultrastructure de la cellule bactérienne

B - Rôle de la paroi

C - Rôle de la capsule lorsqu'elle existe

D - Reproduction des bactéries

 

II - Etude de la physiologie bactérienne

A - Bactéries autotrophes : bactéries hétérotrophes

B - Bactéries aérobies : bactéries anaérobies

 

III - Techniques d'étude des bactéries 

A - Règle indispensable : travailler en milieu stérile

B - Milieux de culture utilisés

C - Ensemencement des Bactéries

D - Isolement d'une souche bactérienne

E - Technique des membranes filtrantes

 

IV - Moyens d'identification des bactéries

A - Caractères morphologiques

B - Caractères physiologiques

C - Caractères biochimiques

D - Caractères immunologiques

 

V - Modalités du pouvoir pathogène 

A - Toxicogénèse

B - Virulence

Les bactéries sont, dans le monde vivant, les êtres qui colonisent le plus de milieux différents. On les trouve pratiquement partout :

dans le sol (lithosphère)

dans les eaux (hydrosphère)

dans l'air (atmosphère)

dans les organismes vivants (biocénose)

Les plus connues sont les bactéries pathogènes, c'est-à-dire celles qui provoquent les maladies mais, il faut savoir que, bien que très importantes qualitativement, ces dernières sont une minorité dans le monde bactérien. Ceuil-ci est en majorité constitué de bactéries non pathogènesindispensables à la vie de l'Humanité (cet aspect sera surtout abordé en Ecologie ).